一,什么是報告基因?報告基因(reporter gene)技術(shù)是常用于檢測轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄活性,或啟動子、增強(qiáng)子等及其中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件活性、或者5’或3’-utr等及其中的調(diào)控元件活性的重要技術(shù)。報告基因既可以用于檢測反式作用因子(trans-element)如轉(zhuǎn)錄因子等的活性,也可以用于檢測順式作用因子(cis-element)如dna中的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點、mrna的3’-utr中mirna結(jié)合位點等的調(diào)控活性。
二,理想的報告基因須具備什么條件呢?
1.表達(dá)產(chǎn)物必須與細(xì)胞內(nèi)源基因相區(qū)別,編碼產(chǎn)物的活性不受宿主細(xì)胞的干預(yù)。
2.報告基因編碼產(chǎn)物的檢測快速簡便、經(jīng)濟(jì)、靈敏高,且重現(xiàn)性好、結(jié)果可靠,測量數(shù)據(jù)應(yīng)該有較寬的線性范圍。
3.細(xì)胞內(nèi)的其它基因產(chǎn)物不會干擾報告基因產(chǎn)物的檢測,同時報告基因的表達(dá)也不改變宿主細(xì)胞的生理功能。
常用的報告基因有:氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶 (cat),β半乳糖苷酶(β-gal或lacz),螢光素酶(luciferase)以及egfp等熒光蛋白。其中螢光素酶報告基因具有檢測便捷、靈敏度高、線性范圍寬、可以進(jìn)行活細(xì)胞和活體檢測等優(yōu)點,使用非常廣泛。
三,什么是螢光素酶?
螢光素酶是自然界中能夠產(chǎn)生生物螢光的酶的統(tǒng)稱。螢光素酶可以催化螢光素氧化成氧化螢光素,在螢光素氧化的過程中,會發(fā)出生物螢光。然后可以通過螢光測定儀(化學(xué)發(fā)光儀)測定過程中釋放的生物螢光(化學(xué)發(fā)光)。目前,最有代表性的是從螢火蟲中分離得到的螢火蟲熒光素酶(firefly luciferase)和從海腎中分離得到的海腎熒光素酶(renilla luciferase),還有近年來研究較多的來源于夏威夷水域的一種大型海洋橈腳類(copepod)動物獲得的gaussia luciferase。
螢火蟲螢光素酶(firefly luciferase)是一種分子量約為61kd的蛋白,在atp、鎂離子和氧氣存在的條件下,可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的過程中,會發(fā)出波長為560nm左右的生物螢光(bioluminescence),是目前體內(nèi)外檢測實驗中的螢光素酶。在此基礎(chǔ)上還有用于高靈敏度檢測的快速降解型螢火蟲熒光素酶,例如pgl6-ta-cp(超靈敏快速降解型報告基因質(zhì)粒) (d2094)。
海腎螢光素酶(renilla luciferase)是一種分子量約為36kd的蛋白,在氧氣存在的條件下,可以催化腔腸素(coelenterazine)氧化成coelenteramide,反應(yīng)過程無需atp和鎂離子參與。在coelenterazine氧化的過程中,會發(fā)出波長為480nm左右的生物螢光(bioluminescence)。
圖1. 螢光素酶的反應(yīng)原理圖
四,實驗應(yīng)用
轉(zhuǎn)錄因子是一種具有特殊結(jié)構(gòu)、行使調(diào)控基因表達(dá)功能的蛋白質(zhì)分子,轉(zhuǎn)錄因子與其靶啟動子中的特異性識別序列結(jié)合,從而對基因的表達(dá)起抑制或增強(qiáng)的作用。借助螢光素和螢光素酶這一生物發(fā)光體系,可以極其靈敏、高效地檢測熒光素酶的表達(dá)水平。從而可以用于檢測轉(zhuǎn)錄因子的活性,基因啟動子、增強(qiáng)子等及其調(diào)控元件的活性或者mrna中5’或3’-utr中的相關(guān)調(diào)控元件活性。
其具體的研究思路簡述如下:
(1)構(gòu)建一個將特定啟動子或增強(qiáng)子,或特定待研究的調(diào)控元件插入到螢光素酶表達(dá)序列前方的報告基因質(zhì)粒。進(jìn)一步借助相應(yīng)調(diào)控元件的突變研究,此時可以用于研究基因啟動子、增強(qiáng)子等及其調(diào)控元件的活性了。
(2)構(gòu)建一個包含多個已知轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的報告基因質(zhì)粒,例如pnfκb-ta-luc (d2207),這樣就可以用于研究細(xì)胞中nfκb這個轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄激活水平了。
(3)構(gòu)建一個包含mrna 3’-utr的報告基因質(zhì)粒,推薦使用pgl6-mir (d2106),把3’-utr放在luciferase的后邊,轉(zhuǎn)錄后luciferase mrna的穩(wěn)定性和轉(zhuǎn)錄活性就會受該3’-utr的調(diào)控。通過3’-utr的點突變等,就可以研究3’-utr的調(diào)控作用以及mirna對于該3’-utr的調(diào)控了。
(4) 通常將上述的報告基因質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞。如果此轉(zhuǎn)錄因子能夠激活靶序列,則螢光素酶基因就會表達(dá),螢光素酶的表達(dá)量與轉(zhuǎn)錄因子的作用強(qiáng)度成正比。3’-utr等可以調(diào)控mrna的穩(wěn)定性和翻譯活性,最終的調(diào)控活性也和熒光素酶的活性正相關(guān)。
(5)加入特定的螢光素酶檢測試劑,螢光素酶與底物反應(yīng),產(chǎn)生螢光,通過檢測螢光的強(qiáng)度可以測定螢光素酶的活性。
圖2. 螢光素酶報告實驗圖解
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